2019年12月10日火曜日

qiita advent calendarにバイオインフォマティクスやメタゲノミクスのカレンダー

プログラミングやコンピュータ関係のtipsを共有するためのプラットフォームサイトでQiitaというのがあり、よく見ている。

https://qiita.com
Qiitaは、プログラマのための技術情報共有サービスです。 プログラミングに関するTips、 ノウハウ、メモを簡単に記録 & 公開することができます。

単純に困った時に調べるために使うことも多いが、ぼーっと見て回って面白い記事を見つけて楽しむことも多い。Qiitaは12月にクリスマスまでの日数をカウントダウンするアドベントカレンダーのサイトを設置している。

https://qiita.com/advent-calendar/2019
Qiita Advent Calendarとは、クリスマスまでの日数をカウントダウンするアドベントカレンダーの習慣にもとづいて毎年12月1日から25日までの期間限定で展開される記事投稿イベントです。毎年、Qiitaとクリスマスを最高に盛り上げる一大イベントとなっております。興味のあるトピックのカレンダーに参加し、この年末を最高に盛り上がる年末にしていきましょう🎉豪華景品がもらえるスポンサーカレンダーもありますので、ぜひ奮ってご参加ください🎄

12/1から12/25まで参加者がトピックのカレンダーを作って、記事をアップしていくというもので、プログラミング言語やデータベース、アプリケーションなどのガチIT系のカレンダーに加えて、学術というカテゴリーのカレンダーも30ほど作られている。今見てみると300人を超える参加者がいるようだ。学術にカテゴライズされるカレンダーにはDeep Learningや機械学習などのコンピュータサイエンス系のものに混じって、メタゲノムやバイオインフォマティクスなど、生物系のトピックスも立っており面白い。

例えば、メタゲノムの12/3の記事は「なぜメタゲノム解析するのか?」

https://qiita.com/i-za-world/items/6b448b52703a23e14a1b
メタゲノマーによるメタゲノマーの為のアドベントカレンダーではありますが、アドベントカレンダー初日なので、ここにいざわーるど解釈の「メタゲノム解析って何?」的なポエム記事を書いておきます。
バイオインフォマティクスのカレンダーは人気らしく、既に全ての日が埋まっているみたいだ。

https://qiita.com/advent-calendar/2019/bioinfo
バイオインフォマティクス(生命情報科学)分野のアドベントカレンダーです。分野の定義など細かいことは問いません。アルゴリズム、ツールの使い方、データベース関係、可視化、計算機の運用、バイオインフォに役立つライブラリやプログラミングテクニック、ワークフローエンジンなどなど、あなたなりのバイオインフォマティクスの知見を共有してください。


12/9の記事は「細菌のゲノムを一つだけ渡された時、どうするか」

https://qiita.com/xvtyzn/items/49cf51b6e6fee9df41af

細菌ゲノムの解析に使うツールなどの説明がされている。細菌ゲノムとかメタゲノムは触ったことがないので知らないツールが多い。色々解説してもらえているので、一通り見てみたいなと思った。

12/23にはナノポアの解析ツールの記事が予定されているようで、これもぜひ読んでみたい。

全然生物とは関係ないが、天文学というカレンダーがある。

https://qiita.com/advent-calendar/2019/tenmongaku

12/3の記事に「赤外線天文衛星「あかり」などの望遠鏡によって撮影された写真をいじってみたり」があり、なんか面白そう。写真も取得できるらしく、丁寧にスクリプトが書かれているので、時間ある時やってみたい。なかなか時間ないけど。